每一个新生儿的诞生,都带来无限希望,然而并不是每个新生命,都可以健康幸运地来到我们身边;每一例重大疾病的确诊,都是一个家庭不愿面对的痛,其实,很多疾病可以通过基因检测,进行早期筛查,提前预防。
生物产业快速发展基因检测不可小觑
中国每年有1400万新生儿、300万新发肿瘤患者,还有1500万肿瘤患病人群。在2017年,国家发改委正式印发了《“十三五”生物产业发展规划》,明确了基因检测能力覆盖50%以上出生人口的目标,利用基因测序、影像、大数据分析等手段,在产前胎儿罕见病筛查、肿瘤、遗传性疾病等方面实现精准的预防、诊断和治疗,更多的疾病也将依赖基因作为主要信息作出诊疗判断。
发展基因产业目前已上升为国家战略,预计2020年,中国有4亿人口的医疗健康信息将包含基因信息。基因信息检测技术和被列入“新型健康技术惠民工程”。但是工具碎片化、开发语言多样、系统维护和升级等技术难题一直在制约基因检测技术的快速发展。容器技术因为标准化封装保证环境一致性、秒级扩缩容、高资源利用率的特点也被基因检测类企业公司青睐,逐渐作为支撑基因检测的核心技术。
上海其明信息技术有限公司(Genminix Informatics co., Ltd.,以下简称其明公司)在基因检测、生物信息领域已发展十三年有余,所开发的基因检测与基因云计算的综合平台GCBI(Gene Cloud of Biotechnology Information)被广大医疗及科研院所接受。通过先进的云计算技术为医疗用户提供更高效,更科学化的建议。华为云CCI服务(全称:云容器实例Cloud Container Instance),以高安全、高性能、低成本、简单易用的优点作为GCBI的底层核心技术支撑,帮助GCBI平台服务于基因检测行业。
华为云CCI支持GCBI平台完成25万+例数据分析
在华为云容器CCI支持下,其明公司基因检测与基因云计算的综合平台GCBI已完成25万例基因数据分析和挖掘、协助作出1万多次基于基因信息的临床决策,参与8万余个疾病相关基因临床信息挖掘研究项目。
GCBI 在整个产业链中,一方面为医疗用户提供重大疾病的风险评估、预警、早期筛查、分子分型、个体化治疗评估监控,服务于精准医学全过程的生物医学大数据参考咨询、分析判断、快速计算和精准决策;另一方面为精准治疗药物的创新开发,推动分子检测技术产品的持续创新,为显著减少无效和过度医疗、避免有害医疗、遏制医疗费用支出快速增长提供大数据平台支撑,使精准医学成为经济社会发展新的增长点。
在GCBI系统中,客户首先将测序仪下机的检测数据提交到GCBI平台,经分析、注释、过滤、评级、解读,最后会给客户生成详细的检测报告,来帮助客户用来指导用药、辅助诊断及预后判断。
基因检测行业的特殊性使计算资源平台挑战诸多
1.业务波动。客户一般会在样品达到一定数量后进行批量处理,因此原始数据来源具有周期性,这就带来了较大的业务波动。其明公司很难规划自己的资源,也很难让自己的资源满负荷运转。
2.高并发。每个样品需要8核至32核容器实例进行计算。客户在提交原始数据后,其明公司需要高并发的计算量在两小时内反馈结果,保证其对客户的SLA。
3.复杂运维。其明公司在自己的公有云虚机资源内纳管了一个小型的K8S集群,并积累了大量的实战经验。但即使如此,对硬件资源和K8S集群的运维依然是件头疼的事,并消耗公司大量人力资源。
华为云CCI多方位承载GCBI核心业务 serverless降低基因测序成本
华为云CCI服务在2018年3月推出公测,也是全球首个基于K8S的商用serverless容器服务,在多方面满足了其明公司的需要:
安全及可靠性:其明公司处理的均是基因类敏感数据,希望自己业务和数据的安全有足够的保障。华为云CCI服务目前采用Kata安全容器技术,将虚拟机成熟的隔离技术应用到容器领域,确保客户业务和数据的安全。
降低运维复杂度:在使用华为云CCI服务之前,其明公司自己维护集群,需要考虑集群的升级、社区bug修复、集群资源利用率等问题。CCI将serverless理念引入到容器领域,客户直接购买和管理容器实例,而无需管理物理资源和K8S集群,同时,CCI提供了可视化的pod CPU/MEM监控功能,可以实时监控处理过程,极大的简化运维成本,让上海其明公司信息技术有限公司可以专注自己的业务。
按需按秒计费:为了保证对医疗及科研客户的交付,其明公司需要按照最大业务量来维护虚机规模,但是这些资源在相当一段时间内处于闲置状态,造成极大的浪费。华为云CCI服务提供按需按秒计费,解决其明公司业务波动性带来的成本难问题。经过上海其明公司信息技术有限公司仔细测算,按需按秒计费比包年包月节省成本高达50%。
秒级伸缩及高并发:其明公司发现每次启动虚机,集群和节点纳管、业务上线时间就需要近20分钟。即使是业务扩容,也需要耗费10多分钟。华为云CCI支持秒级伸缩和高并发,kata容器启动速度实测600ms,集群规模高达上十万容器实例,让其明公司便无需为自己满足客户SLA感到担心。
其明公司开发总监蔡家华表示:“通过将自己的业务部署在CCI上,实际计算成本降低30%-50%,并且实现了K8S和物理资源免运维。其明公司非常高兴华为云CCI服务可以帮助自己实现一系列成本的降低,提升客户SLA的服务标准,让自己可以更聚焦业务和客户。”
华为云CCI不仅仅帮助其明公司解决底层技术难题,全力聚焦业务创新,还助力其明公司与其他合作伙伴达成价值联动,助力基因检测科研的深入发展。基于华为云原生应用平台,华为云CCI不断挖掘技术在多种医疗场景下可实现的应用创新,为生物产业的繁荣发展加力续航。
- 蜜度索骥:以跨模态检索技术助力“企宣”向上生长
- GitLab将告别中国区用户:是时候选择新的“极狐”或保护账号了
- 苹果明年推至少22款新品,阿里非洲首站启动,科技新品盛宴拉开帷幕
- SUSE预测:未来私有AI平台崛起,让我们共同见证AI的未来
- AI伴侣“小奇”:奇富科技重塑金融服务体验的探索之作
- 揭秘软银孙正义神秘芯片计划:打造超越NVIDIA的未来科技新星
- 大模型创企星辰资本获数亿融资,腾讯启明等巨头入局,人工智能新篇章开启
- 大模型独角兽阶跃星辰融资新动态:数亿美金B轮,揭秘星辰未来之路
- 哪吒汽车创始人资金遭冻结,1986万元股权风波引关注
- 本田与日产酝酿合并:明年6月敲定协议,新公司社长待本田推荐
- 金融大模型新突破:百川智能Baichuan4-Finance引领行业,准确率领先GPT-4近20%,变革金融业未来
免责声明:本网站内容主要来自原创、合作伙伴供稿和第三方自媒体作者投稿,凡在本网站出现的信息,均仅供参考。本网站将尽力确保所提供信息的准确性及可靠性,但不保证有关资料的准确性及可靠性,读者在使用前请进一步核实,并对任何自主决定的行为负责。本网站对有关资料所引致的错误、不确或遗漏,概不负任何法律责任。任何单位或个人认为本网站中的网页或链接内容可能涉嫌侵犯其知识产权或存在不实内容时,应及时向本网站提出书面权利通知或不实情况说明,并提供身份证明、权属证明及详细侵权或不实情况证明。本网站在收到上述法律文件后,将会依法尽快联系相关文章源头核实,沟通删除相关内容或断开相关链接。